Die Äbtissin Barbara von Castelmur, hatte die Herausforderungen von Pest und Reformationswirren zu bestehen. Sie versprach der Bevölkerung von Müstair die immerwährende Benützung der Klosterkirche als Pfarrkirche. Es gab eine Abstimmung, die Stoff für Legenden lieferte. Fazit ist, dass Müstair als einziges Dorf im schweizerischen Val Müstair katholisch blieb. Als sichtbares Zeichen für die Pfarrkirche entstand um 1530 der Kirchturm.
Die ersten drei Geschosse des Turms wurden innert vier Jahren errichtet, die Glockenstube entstand über 50 Jahre später. Der heutige Glockenstuhl wurde um 1644 eingebaut. Im Turm befinden sich vier Glocken, die beiden kleinsten entstanden kurz nach der Calvenschlacht 1504 und sind die ältesten Glocken im ganzen Tal. 1558 entstand die grösste, 107 Jahre später die vierte. Das Glockengeläute ist heute elektronisch programmiert. Der Akkord der vier Glocken d' / e' / cis'' / f'' ist sehr speziell. Diese Tonfolge ist unüblich und gibt dem Geläut eine starke Charakteristik und Originalität.
